یک مدل بازی مشارکتی برای تحلیل داده های بیان ژنی آزمایش ریزآرایه

Authors

یونس کردوندی

حمیدرضا نویدی

مجید حسن پور عزتی

abstract

فناوری ریزآرایه یک ابزار تحلیلی کوچک است که به کمک آن می توان بیان ده ها هزار ژن را، به طور همزمان مورد کاوش قرار داد. سوال عمده مورد بحث در ریزآرایه ها، چگونگی انتخاب مارکرهای ژنی می باشد، تشخیص مارکرهای ژنی می تواند تشخیص زودتر، درمان و پیش بینی دقیق تر نتیجه بیماری ومتعاقب آن استفاده از درمان های مناسب وکاهش هزینه ها را در پی داشته باشد.با استفاده از نظریه های آماری برای پردازش داده های ریزآرایه، تنهاقادر به شناسایی تعداد معدودی از ژن های با نظم متفاوت در نمونه های تحت بررسی خواهیم بود. به منظور تقویت سیگنال های حاوی اطلاعات مفید بیولوژیکی، اخیراً محققان نظریه بازی توانسته اند روشی را ابداع نمایند که با به کارگیری آن روی داده های بیان ژنی آزمایش ریزآرایه، قادر خواهیم بود گروهی از ژن های با تاثیرگذاری مضاعف در بروز یک اختلال را شناسایی کنیم. در این روش، با استفاده از نظریه بازی های همکارانه، به مدل سازی سهم مشارکت هر یک از ژن های دخیل در بروز یک اختلال که بیان شان دچارتغییر شده است، پرداخته می شود. . در این تحقیق، مدل مذکور با ترکیب حلی مفهوم ارزش شیپلی از بازی های همکارانه با قابلیت انتقال سودمندی به همراه مفهوم بوت استرپ آماری، گزینشی از ژن های با تاثیرگذاری مضاعف در بروز یک اختلال مورد بررسی قرار گرفته است. در یک مطالعه موردی، این مدل سازی روی داده های به دست آمده از افراد مبتلا به بیماری اوتیسم اجرا شده است. نتایج به دست آمده از این پژوهش همخوانی بالایی با نتایج تحقیقات بیولوژیک از خود نشان می دهد.

Upgrade to premium to download articles

Sign up to access the full text

Already have an account?login

similar resources

شبکه های بیان ژنی برای آنالیز داده ماکرواری DNA

بر خلاف دیدگاه تقلیل گرایانه بیولوژی کلاسیک ، رویکرد کل نگر در بیولوژی با انفجار در پیشرفت تکنیک هایی با تکنولوژی بالا و تولید حجم عظیم داده خود را نشان داده است . اکنون چالش بیولوژیست ها کشف روش های تحلیل این داده ها است تا بتوانند در رسیدن به درک سیستم پویای پیچیده حیات کمک کنند. در بین تکنولوژی های بسیار پیشرفته اخیر که بیشترعمومی هستند میکرواری DNA از مشهورترین آن ها است . میکرواری،سطوح بیا...

full text

تحلیل خانواده‌های ژنی در ریزآرایه لنفوبلاستیک حاد

  سابقه و هدف: تحلیل خانواده ژنی داده‌های ریزآرایه، مسیرهای بیولوژیکی یا خانواده‌های ژنی که بین فنوتیپ‌های مورد نظر بیان متفاوتی دارند، را شناسایی می‌کند. بر خلاف تحلیل مبتنی بر ژن‌های منفرد، تحلیل خانواده‌های ژنی دانش بیولوژیکی موجود روی ژن‌ها را برای بررسی تفاوت بیان ژنی بین فنوتیپ‌ها به کار می‌گیرد. در این مطالعه به مقایسه دو روش تحلیل خانواده‌های ژنی پرداخته می‌شود. مواد و روش‌ها: از ...

full text

شبکه های بیان ژنی برای آنالیز داده ماکرواری dna

بر خلاف دیدگاه تقلیل گرایانه بیولوژی کلاسیک ، رویکرد کل نگر در بیولوژی با انفجار در پیشرفت تکنیک هایی با تکنولوژی بالا و تولید حجم عظیم داده خود را نشان داده است . اکنون چالش بیولوژیست ها کشف روش های تحلیل این داده ها است تا بتوانند در رسیدن به درک سیستم پویای پیچیده حیات کمک کنند. در بین تکنولوژی های بسیار پیشرفته اخیر که بیشترعمومی هستند میکرواری dna از مشهورترین آن ها است . میکرواری،سطوح بیا...

full text

تحلیل خانواده های ژنی در ریزآرایه لنفوبلاستیک حاد

سابقه و هدف: تحلیل خانواده ژنی داده های ریزآرایه، مسیرهای بیولوژیکی یا خانواده های ژنی که بین فنوتیپ های مورد نظر بیان متفاوتی دارند، را شناسایی می کند. بر خلاف تحلیل مبتنی بر ژن های منفرد، تحلیل خانواده های ژنی دانش بیولوژیکی موجود روی ژن ها را برای بررسی تفاوت بیان ژنی بین فنوتیپ ها به کار می گیرد. در این مطالعه به مقایسه دو روش تحلیل خانواده های ژنی پرداخته می شود. مواد و روش ها: از دو روش ط...

full text

توسعه یک مدل تحلیل پوششی داده ها برای ارزیابی عملکرد تولید به همراه یک مطالعه موردی

در دنیای رقابتی امروز، سازمان ها دائماً در حال بررسی، ارزیابی و بازنگری عملکرد خود و رقیبان خود میباشند. با درک اجزای تشکیل دهنده عملکرد شرکت ها و شناسایی ناکارامدی های یک سیستم، سازمان می تواند جایگاه خود را در بازار ارتقاء دهد. تحلیل پوششی دادهها به عنوان رویکردی پذیرفته شده برای مقایسه و ارزیابی عملکرد کاربردهای گسترده ای یافته است. در این تحقیق از تحلیل پوششی دادهها برای ارزیابی عملکرد ماهان...

full text

الگوریتم های خوشه بندی دوبعدی در داده های بیان ژنی: یک مطالعه مروری

در سال های اخیر تکنولوژی ریز آرایه امکان مشاهده و بررسی بیان هم زمان هزاران ژن را وقتی سلول تحت شرایط مختلف یا پروسه های متفاوت قرار می گیرد را فراهم کرده است و نقشی اساسی در سرعت بخشیدن و بالا رفتن کارایی مطالعات بیان ژنی ایفا می کند. یکی از مهم ترین تکنیک های تشخیص الگو در داده های بیان ژنی تحلیل خوشه بندی دوبعدی است که می تواند گروه هایی از ژن ها با الگو های بیان شده مشابه را بیابد. مطالعه ح...

full text

My Resources

Save resource for easier access later


Journal title:
تحقیق در عملیات در کاربردهای آن

جلد ۱۰، شماره ۴، صفحات ۰-۰

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com

copyright © 2015-2023